目前， CIJ 技術所面臨的諸多挑戰：

  1、生產環境及行業應用對連續式噴墨噴碼技術提出了新的挑戰。

  高速生產線要求連續式噴墨噴碼技術能夠保持同步。一個現代化的軟飲料罐裝線每分鐘可生產2000罐飲料，即每秒33罐。如果產品隨著包裝線高速移動而噴碼機無法保持同等速度，或者噴碼機在生產線上未安裝得當（打印頭與產品的距離、角度等），不僅將導致噴碼錯誤，對打印質量也有明顯影響，會出現信息未能打印在應該打印的位置，或者打印在產品表面或標簽上的字體“拉伸變形”等不良噴碼情況。

  現代化生產環境要求所有流程均能承受極端的速度和嚴苛的環境，某些產品可能需要在極端條件（如殺菌或快速冷凍）下進行生產，也有可能需要長時間暴露在潮濕或布滿粉塵的生產環境中。這就要求CIJ設備能經受最嚴苛環境的考驗，打印的信息也要持久，與產品的流通周期保持一致。

  眾多制造行業中零部件的微型化也要求標識打印達到新的精度水準。電子產品日益微型化，使得產品的打碼也必須更小、更精密，甚至，產品的每一個部件都需要單獨打碼，正如一只手機通常有1200個零件均需打碼。對于CIJ連續式噴墨噴碼技術而言，這往往是一個相當困難的任務，CIJ墨水需要噴射在快速移動的物體上，并且確保精確度。

  2、全球化市場使得可追溯性和防偽需求不斷增加。

  假冒產品對于消費者的健康及安全有巨大風險，尼爾森和 ACMA（印度車輛零件制造商協會）研究表明，印度20%道路交通事故是由假冒汽車零件引起的。假冒產品的任意肆虐催生了更為嚴格的產品標識立法，產品的可追溯性也日漸成為一項必備要求。依靠產品標識使產品在復雜而相互關聯的行為中，從生產到分銷，直至消費等各環節中都能進行追蹤追溯。

  事實證明，標識系統的實施是制造商及零售商實施產品追蹤追溯的有效工具。產品追蹤追溯解決方案使得單個物品或一批貨品能夠在運行中進行分析，或是通過序列化標識在整個供應鏈中被追蹤。而不盡人如易的標識將意味著無法在供應環節中被識別。標識用于追蹤追溯必須具備準確的位置、精密的噴墨、可讀性高，并且能承受環境或搬運時造成的磨損。

  3. 消費者要求不斷提高產品信息的透明度及詳盡度

  產品信息的透明度及詳盡度也越來越多地得到法律的支持。現在，許多消費產品必須顯示過敏原和產品來源，這需要在較小的打印區域內清晰可辨地打印更多信息。而更多地出于產品安全性追蹤追溯的立法，則要求產品包裝上賦上追蹤追溯碼，如醫藥產品的電子碼等。根據Planet Retail和GS1開展的一項調查發現，24%的購物者會使用智能手機掃描產品條碼獲取產品的更多信息，清晰的信息顯示、可讀的條碼打印都是需要連續式噴墨噴碼技術來高質量完成的。

  4. 產品促銷代碼的可讀性要求越來越高

  貨架促銷在品牌營銷中被越來越多的運用，通常是作為多渠道營銷活動的一部分，這一促銷方式衍生出可變二維矩陣碼—QR碼的運用，來鼓勵消費者登陸營銷活動的專門網頁。此類標識精準度需要達到智能手機可讀的標準，對于連續式噴墨噴碼技術而言，歷來都是挑戰之一。

  CIJ技術面臨的這些挑戰，有些與連續式噴墨噴碼系統本身相關，有時是選擇的墨水引起的。

  要達到一定的打印質量，需要“因地制宜”。某些情況下，標識分辨率不夠高，可能是設備需要更多的墨滴才能達到預期的清晰度。而有些時候，打印質量差可能是由于生成的墨滴欠佳，導致在所打印字體的附近出現飛濺的墨點，即所謂的“衛星點”。另外，標識模糊或缺損而難以辨認，也可能是沒有選擇正確的墨水，墨水質量欠佳或者附著力低等原因導致的。